228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2743 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  76.34 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  76.88 
 
 		 186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  77.96 
 
 		 186 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  76.22 
 
 		 185 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  76.22 
 
 		 185 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  75.27 
 
 		 186 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  78.38 
 
 		 185 aa  300  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  72.97 
 
 		 185 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  71.89 
 
 		 185 aa  286  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  70.97 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  44.32 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  38.2 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.29 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  34.48 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  34.83 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  35.16 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  39.89 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  34.86 
 
 		 278 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 259 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  36.16 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  36.16 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  35.2 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  33.71 
 
 		 292 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  35.16 
 
 		 242 aa  99  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  31.49 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  32.58 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  33.92 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  34.88 
 
 		 245 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 226 aa  95.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.39 
 
 		 234 aa  94.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 		 266 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  30.94 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.61 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 259 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.61 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  31.49 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  29.73 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  32.96 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  29.71 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  36.87 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  33.71 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  37.3 
 
 		 252 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  37.3 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  37.3 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  33.16 
 
 		 243 aa  88.2  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  34.44 
 
 		 211 aa  88.2  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  32.6 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  32.18 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  35.71 
 
 		 299 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  33.89 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.1 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  33.51 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  32.95 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 		 227 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  39.06 
 
 		 230 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  31.61 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  35.54 
 
 		 257 aa  85.1  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  30.17 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 		 217 aa  84.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  35.71 
 
 		 219 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  33.55 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  35.71 
 
 		 226 aa  84.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  29.78 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  29.61 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  31.11 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  29.71 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  29.71 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  28.11 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  29.05 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>