246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0973 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  99.61 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  91.89 
 
 
278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  91.12 
 
 
259 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  87.26 
 
 
292 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  90.73 
 
 
259 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  78.86 
 
 
247 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  78.05 
 
 
245 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  64.29 
 
 
266 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  66.67 
 
 
252 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  66.67 
 
 
299 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  52.68 
 
 
223 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  58.37 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  53.69 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  55.05 
 
 
230 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  56.46 
 
 
221 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  56.46 
 
 
221 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  53.67 
 
 
227 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  53.66 
 
 
224 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  48.08 
 
 
217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  56.4 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  57.49 
 
 
226 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  55.17 
 
 
221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  56.9 
 
 
227 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  55.25 
 
 
219 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  64.18 
 
 
226 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  50 
 
 
179 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  47.06 
 
 
182 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  47.9 
 
 
219 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.89 
 
 
256 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  45.31 
 
 
211 aa  151  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.88 
 
 
178 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  46.2 
 
 
368 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 
186 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 
186 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  45.59 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  45.59 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  38.38 
 
 
253 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  34.24 
 
 
189 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  34.78 
 
 
189 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 
185 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  40.23 
 
 
197 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  44.93 
 
 
221 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  35.23 
 
 
185 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  35.33 
 
 
185 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  34.66 
 
 
185 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  38.07 
 
 
221 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  32.97 
 
 
199 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  43.8 
 
 
180 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.53 
 
 
180 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 
186 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  42.75 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  33.5 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.78 
 
 
186 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
178 aa  92.8  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  36.57 
 
 
181 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 
186 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 
213 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  37.21 
 
 
190 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  43.8 
 
 
189 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  36.42 
 
 
180 aa  91.7  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  36.84 
 
 
179 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  43.09 
 
 
177 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 
450 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 
364 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 
179 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  32.02 
 
 
185 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  36.43 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  38.18 
 
 
180 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  32.37 
 
 
196 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  38.21 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  30.81 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.21 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.21 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  34.93 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  32.22 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  37.39 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  28.9 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  30.23 
 
 
196 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  28.65 
 
 
195 aa  82  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 
213 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 
196 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  32.35 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  35.45 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  32 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  33.14 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>