203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1886 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  50 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  48.99 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  48.99 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  47.03 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  48.48 
 
 		 196 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  47.98 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  47.98 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  47.47 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  47.67 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  48.73 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  46.31 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  48.5 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  44.21 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  42.16 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  40.93 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  40.31 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  39.9 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.83 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  36.08 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  36.41 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  37.06 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  38.81 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  32.16 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  31.19 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  32.62 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  32.61 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  31.63 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  31.63 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  31.63 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  37.04 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  37.04 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 		 243 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  31.12 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  33.87 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  34.68 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  32.43 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  29.51 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  31.32 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  30.9 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  34.05 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  31.16 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  31.28 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  29.57 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  30.98 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  35.34 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  31.46 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.74 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  34.15 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  32.58 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  31.21 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  33.33 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1857  Smr protein/MutS2  27.64 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  30.11 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  38.74 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  29.94 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  33.09 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  27.78 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  31.43 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  29.78 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  32.09 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  34.48 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  28.42 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  27.62 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  28.96 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  30.07 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  28.42 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  31.39 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  34.21 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  32.26 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  37.07 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  30.99 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  28.02 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>