209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0119 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  61.24 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  60.3 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  59.09 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  61.38 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  57.73 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  57.97 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  43.35 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  43.35 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  44.89 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  42.25 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  43.15 
 
 		 199 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  41.29 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  47.09 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  41.58 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  40.38 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  41.01 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  43.18 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  40.96 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  43.75 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  44.75 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  42.31 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  41.33 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  37.7 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  42.58 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  37.37 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  40.28 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  41.81 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  57 
 
 		 262 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  35.15 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  35.11 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  42.97 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  56 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  44.24 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  31.82 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  38.24 
 
 		 450 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  26.61 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  30.06 
 
 		 369 aa  68.2  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  36.3 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  27.52 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  38.24 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  27.66 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  35.78 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  28 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  35.37 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.04 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  35 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  30.83 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  30.83 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.83 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  30.83 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  30.83 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  35.16 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  36.27 
 
 		 364 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  40.2 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  35.19 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  36 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  30 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  40.21 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  26.95 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  37.62 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  27.37 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  39.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  29.57 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  39 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  36.27 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  28.04 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  37.62 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  36 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  34.68 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  39.18 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  37 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.14 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.25 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  33.1 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  38.14 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>