229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3602 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  44.9 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  42.16 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  40.7 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  44.79 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  43.43 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  41.79 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  61.76 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  47.58 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  36.45 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  39.22 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  40.22 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  40.22 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  37.3 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  39.11 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  41.26 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  59.41 
 
 		 262 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  37.68 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  37.97 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  44.83 
 
 		 450 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  37.95 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  55.05 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  37.07 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  47.62 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  37.07 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  51.46 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  40.22 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  41.9 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  40.68 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  53.21 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  34.95 
 
 		 275 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  42.24 
 
 		 364 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  32.07 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  47.71 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  57.43 
 
 		 261 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  36.32 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  38.24 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  57.43 
 
 		 256 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  36.7 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  37.63 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  48 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.41 
 
 		 313 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  32.07 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  20.83 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  42.16 
 
 		 369 aa  85.5  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  38.79 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40.49 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  38.79 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  40.18 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  27.42 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  33.65 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  29.17 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  41.44 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  31.62 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  28.65 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  48.84 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  36.62 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  36.63 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.62 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  32.45 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  42.42 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  37.04 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  40.4 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  41.41 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  40.4 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  35.63 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  40.4 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  40.4 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  43.56 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  29.17 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  34 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  45.45 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  29.63 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  29.17 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  38.02 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  38.38 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  39.6 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.17 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  29.35 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  38.38 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  39.81 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  29.17 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  42.61 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  38.84 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  33.94 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  45.36 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  45.36 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  37.37 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  38.61 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  32.48 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  39.05 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  39.05 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  33.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>