218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4124 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  34.7 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  36.42 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  35.12 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  31.28 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  30.73 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.63 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  32.97 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  43.09 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  39.5 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  34.91 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  34.73 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  33.88 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  34.8 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  31.32 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  31.32 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  41.74 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.06 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.06 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  30.22 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  35.26 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.06 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.31 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  40.87 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.67 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  40.87 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  32.06 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  40.87 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  32.63 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  32.02 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  38 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  35.43 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  29.81 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  33.15 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  37.6 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  29.81 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  37.02 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  29.31 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  34.12 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  30.51 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  30.77 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  29.89 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  25.34 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  42 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  42.7 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  32.12 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  40.23 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  39.8 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  37.38 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  36.73 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.16 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  36.88 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  39.62 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.26 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  35.66 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  26.52 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  34.57 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  33.77 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  31.46 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  32.26 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  34.46 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  37.39 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  27.27 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  42.05 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  38.54 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  34.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1857  Smr protein/MutS2  27.53 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  38.54 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  36.11 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  34.82 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  34.51 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  35.26 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  29.55 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>