206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0109 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 192 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  61.88 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  57.28 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  58.67 
 
 		 197 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  59.47 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  57.3 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  57.58 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  48.65 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  42.86 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  40.76 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  42.86 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  40.61 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  48.62 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  40.58 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  40.72 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  40.72 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  42.63 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  40.22 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  39.8 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  42.08 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  40.61 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  36.32 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  59.05 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  42.01 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  58 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  35.9 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  43.15 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  37.75 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  38.74 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  34.85 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  56 
 
 		 261 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  56 
 
 		 256 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  31.16 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  45.63 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  45.54 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  41 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  27.17 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  38.24 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  29.09 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  23.89 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  30.65 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  38 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  37.5 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  44 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  33.61 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  44.14 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  35 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  32.6 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  32.07 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  30.39 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  31.41 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  33.66 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  36.11 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  39.62 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  38.2 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  28.57 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  29.14 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  37.72 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  37.72 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  40.95 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  29.35 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  29.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  29.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  29.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  39 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  37 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  37 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  28.25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  34 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  30.22 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  30.48 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  38.61 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  28.95 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  31.06 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  40 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  45.56 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  41.11 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  31.07 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  35.58 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  28.95 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  28 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  33.55 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  28.57 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  42.5 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  37.37 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 		 299 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  27.72 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  32.91 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.76 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>