141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2050 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 196 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  46.8 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  48.5 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  47.09 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  45.03 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  44.91 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  44.78 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  45.99 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  43.43 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  41.38 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  38.71 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  41.84 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  41.21 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  38.34 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  38.34 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  58 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  46.63 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  43.52 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  43.27 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  40.61 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  38.59 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  50.42 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  33.96 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  57 
 
 		 261 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  57 
 
 		 256 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  34.54 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  39.58 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  39.9 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  38.61 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  37.44 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  37.44 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  37.37 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  37.86 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  24.06 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  21.54 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  36.32 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  25.86 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  32.31 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  36.46 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  35.59 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  41.38 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 450 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  43.52 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  32.93 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  35.88 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  31.09 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  38.26 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  36.69 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  38.24 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  31.72 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  42.27 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  28.68 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36.97 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  29.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  28.64 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  33 
 
 		 313 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  40.52 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  36.97 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  29.29 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  34.31 
 
 		 364 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  28.93 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  41.28 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  26.56 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  26.04 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  35.06 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  35.58 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  27.46 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  27.46 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  27.46 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  27.46 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  37.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  25.52 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  27.97 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  25.14 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  25.14 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  27.82 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  31.98 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  34.02 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  27.09 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  38.53 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  25.91 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  30.88 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  39.8 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  23.44 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  38.68 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  26.6 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.31 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  30.87 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  32.12 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>