177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3944 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  88.36 
 
 
188 aa  316  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  66.86 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  64.67 
 
 
191 aa  222  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  51.38 
 
 
200 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  50.83 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  48.22 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  41.57 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 
198 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  42.55 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  38.92 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  37.67 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  41.27 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  39.34 
 
 
191 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  38.92 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  41.49 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 
196 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  39.15 
 
 
186 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 
185 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  34.01 
 
 
199 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  53.47 
 
 
262 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  47.62 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  37.43 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  35.18 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  35.27 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  34.78 
 
 
198 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  47.52 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  34.7 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  46.53 
 
 
261 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  36.67 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  35.11 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  33.95 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  32.08 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  40.38 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  28.35 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  30.84 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  36 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  23.16 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  31.73 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  33.6 
 
 
236 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  34.69 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  34.38 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
275 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  38.54 
 
 
240 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  30 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  32 
 
 
234 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
221 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  35.24 
 
 
270 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  36.73 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  31.43 
 
 
364 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
221 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  28.65 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  35.19 
 
 
259 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 
259 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  28.65 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 
259 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  29.63 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  33.67 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.67 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  36.46 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  32.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.67 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  33.08 
 
 
218 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  34.26 
 
 
292 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  28.09 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  33.65 
 
 
299 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  38.38 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  32.32 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  29.84 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  34.26 
 
 
278 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  35 
 
 
252 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
266 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.14 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.52 
 
 
313 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  26.51 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  32.73 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  32.14 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  37.8 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
247 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  32.71 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  32.35 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  32.29 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  31.43 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>