142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1562 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 256 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  93.87 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  63.24 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  50.58 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  71.93 
 
 		 186 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  70.18 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  38.8 
 
 		 198 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  39.36 
 
 		 197 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  54.2 
 
 		 191 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  38.55 
 
 		 194 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  39.44 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  55.74 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  57.39 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  39.9 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  45.8 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  39.9 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  54.92 
 
 		 200 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  55.65 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  50 
 
 		 189 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  50.88 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  51.33 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  45.1 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  49.59 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  34.11 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  53.77 
 
 		 180 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  38.69 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  48.67 
 
 		 202 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  36.36 
 
 		 195 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  50.94 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 179 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  49.06 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  49.06 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  28 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  42.61 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  25.86 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  34.86 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  25.64 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  37.72 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  38.32 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  32.17 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  42.06 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  37.96 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  38.6 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  34.48 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  38.6 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  38.6 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40.87 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  31.18 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  38.79 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  28.31 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  38.6 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  27.88 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  41.23 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  35.25 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  37.74 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  36 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  35.19 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  37.07 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  42.71 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  37.72 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  39.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  39.58 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  29.01 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  26.22 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  31.58 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  34.45 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  29.48 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.17 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  34.21 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  28.24 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  37.74 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  28.24 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.61 
 
 		 180 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  35 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  34.21 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  32.28 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  28.48 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.79 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  30.06 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  28.48 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  28.48 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  28.48 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  30.06 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  28.48 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  27.08 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>