153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3832 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 190 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  46.52 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  51.13 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  32.32 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  32.32 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  33.16 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  34.03 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  35.07 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  34.48 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  36.8 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  28.65 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  34.33 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  35.98 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  32.43 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  39.66 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  26.26 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  33.15 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  29.23 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  29.23 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  24.87 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  31.22 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36.61 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  29.9 
 
 		 275 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  27.72 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  35.4 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  31.14 
 
 		 450 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  27.98 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  27.98 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  27.89 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  36.61 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  25.41 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  29.91 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  30.37 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  28.7 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  32.46 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  31.58 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  33.16 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  28.44 
 
 		 313 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  33.02 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  28.88 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  23.94 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  28.14 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  28.04 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  26.63 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  31.41 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  28.34 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.58 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  31.13 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  30.7 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  27.59 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  27.42 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  30.7 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  30.51 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  30.7 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  30.28 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  26.63 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  29.06 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  27.08 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  31.18 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  30.7 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  30.19 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  28.66 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  23.71 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  33.62 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  33.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  30.28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  29.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  28.19 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  36.11 
 
 		 233 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  25.76 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  33.02 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  25.76 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  25.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  25.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  25.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  28 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  25.76 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  28.21 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  32.48 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  30.28 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  27.52 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  30.56 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  34.55 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  26.67 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  35.58 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  28.44 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  27.69 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  27.12 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  27.12 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>