170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1865 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1865  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00151005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  30.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  32.82 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  32.82 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  38.55 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.36 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  39.53 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  40.96 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  40.96 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  39.53 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  40.48 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  40.48 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  36.14 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  36.14 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  36.14 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  29.34 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  38.37 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  37.08 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  38.1 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  35.63 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  37.93 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  42.17 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  33.72 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  36.78 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  36.05 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  36.14 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  36.9 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  39.53 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  33.71 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  31.4 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  39.53 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  31.76 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  37.35 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.56 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  32.56 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  33.72 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  36.14 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  34.88 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  34.94 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  36.59 
 
 		 793 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  37.93 
 
 		 779 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30 
 
 		 789 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1072  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.74 
 
 		 735 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.328877  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0683  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.96 
 
 		 735 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  26.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1196  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.76 
 
 		 735 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  28.24 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  36.36 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.36 
 
 		 731 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  28.24 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  28.24 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  31.76 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  30.23 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  31.46 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  36.36 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  38.1 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  26.54 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  30.59 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  36.59 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  33.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  23.08 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.03 
 
 		 776 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  31.46 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  35 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  27.2 
 
 		 793 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  38.1 
 
 		 791 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  21.98 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>