More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1155 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0494  Smr protein/MutS2  54.42 
 
 		 733 aa  779    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  100 
 
 		 731 aa  1455    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1196  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  74.52 
 
 		 735 aa  1086    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0248  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  60.25 
 
 		 734 aa  879    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0683  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  73.7 
 
 		 735 aa  1075    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0755  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.99 
 
 		 740 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1688  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  56.15 
 
 		 733 aa  813    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1072  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  73.42 
 
 		 735 aa  1073    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.328877  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0624  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  59.89 
 
 		 733 aa  870    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0203068  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0988  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  58.74 
 
 		 735 aa  876    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  26.19 
 
 		 804 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  25.11 
 
 		 804 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  25.81 
 
 		 794 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  24.87 
 
 		 789 aa  177  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.78 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  25.96 
 
 		 769 aa  175  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  24.89 
 
 		 796 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  23.39 
 
 		 784 aa  174  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.91 
 
 		 782 aa  174  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  25.79 
 
 		 786 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  26.03 
 
 		 789 aa  173  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  28.89 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  25.15 
 
 		 793 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  25.42 
 
 		 791 aa  171  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  25.15 
 
 		 794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  25.4 
 
 		 789 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  25.48 
 
 		 775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.45 
 
 		 786 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.04 
 
 		 786 aa  164  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  27.16 
 
 		 803 aa  163  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.3 
 
 		 786 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.3 
 
 		 786 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.53 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  25.86 
 
 		 776 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  27 
 
 		 750 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  25.33 
 
 		 771 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.75 
 
 		 782 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.75 
 
 		 782 aa  159  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  26.36 
 
 		 828 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  28.84 
 
 		 791 aa  159  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  25.73 
 
 		 780 aa  158  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  26.94 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  24.75 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.93 
 
 		 784 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.94 
 
 		 786 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  22.07 
 
 		 782 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  24.22 
 
 		 796 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  25.3 
 
 		 793 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  25.86 
 
 		 763 aa  155  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  24.13 
 
 		 788 aa  154  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  27.05 
 
 		 781 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  26.86 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  24.68 
 
 		 800 aa  154  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  23.96 
 
 		 791 aa  152  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  24.49 
 
 		 820 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  27.52 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  27.52 
 
 		 757 aa  151  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  25.41 
 
 		 761 aa  150  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.02 
 
 		 786 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  24.95 
 
 		 788 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  26.93 
 
 		 805 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  24.53 
 
 		 802 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  25.58 
 
 		 817 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.46 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  26.68 
 
 		 760 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.99 
 
 		 786 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.59 
 
 		 757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.4 
 
 		 791 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  25.35 
 
 		 826 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  23.75 
 
 		 793 aa  147  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  22.8 
 
 		 780 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  25.66 
 
 		 765 aa  147  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  23.63 
 
 		 806 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  27.78 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  23.74 
 
 		 793 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  22.81 
 
 		 767 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  24.7 
 
 		 779 aa  144  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  26.09 
 
 		 785 aa  143  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  24.83 
 
 		 792 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  25.49 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  23.01 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.03 
 
 		 805 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.78 
 
 		 830 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.78 
 
 		 830 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  25.64 
 
 		 776 aa  140  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  23.22 
 
 		 774 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.22 
 
 		 774 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  26.57 
 
 		 792 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  21.54 
 
 		 801 aa  133  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  27.9 
 
 		 797 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  25.09 
 
 		 785 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  22.84 
 
 		 792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  23.96 
 
 		 840 aa  127  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  26.34 
 
 		 803 aa  127  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  23.93 
 
 		 783 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>