More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1688 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0683  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  55.89 
 
 		 735 aa  815    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0494  Smr protein/MutS2  50.95 
 
 		 733 aa  732    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1072  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  56.03 
 
 		 735 aa  818    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.328877  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1196  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  56.3 
 
 		 735 aa  822    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1688  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  100 
 
 		 733 aa  1472    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0988  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  60.14 
 
 		 735 aa  900    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  56.15 
 
 		 731 aa  785    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0248  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  62.01 
 
 		 734 aa  901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0624  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  62.62 
 
 		 733 aa  953    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0203068  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0755  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.19 
 
 		 740 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  27.07 
 
 		 791 aa  178  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  25.48 
 
 		 804 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  25.71 
 
 		 782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  23.66 
 
 		 784 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  23.82 
 
 		 791 aa  164  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.74 
 
 		 782 aa  164  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  22.04 
 
 		 789 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.85 
 
 		 782 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.19 
 
 		 782 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.19 
 
 		 782 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  23.92 
 
 		 769 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  24.62 
 
 		 789 aa  160  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  26.11 
 
 		 757 aa  160  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  23.72 
 
 		 789 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  26 
 
 		 804 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  25.58 
 
 		 785 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  24.48 
 
 		 780 aa  157  6e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  25.4 
 
 		 779 aa  156  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  26.38 
 
 		 775 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  25.07 
 
 		 787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.76 
 
 		 786 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.76 
 
 		 786 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  23.73 
 
 		 793 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  25.22 
 
 		 794 aa  154  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  24.62 
 
 		 771 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  24.09 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.61 
 
 		 784 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  24.28 
 
 		 803 aa  152  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  25.7 
 
 		 791 aa  152  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  23.27 
 
 		 750 aa  151  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  25.77 
 
 		 794 aa  151  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  24.51 
 
 		 776 aa  150  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  25.21 
 
 		 786 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  23.85 
 
 		 765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  23.8 
 
 		 780 aa  149  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  22.94 
 
 		 776 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  23.6 
 
 		 761 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  23.87 
 
 		 796 aa  147  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  24.85 
 
 		 778 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.67 
 
 		 786 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  26.14 
 
 		 781 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.52 
 
 		 786 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.59 
 
 		 786 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  26.32 
 
 		 817 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.52 
 
 		 786 aa  144  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.67 
 
 		 786 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  24.11 
 
 		 793 aa  144  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  25.74 
 
 		 804 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.52 
 
 		 786 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  26.18 
 
 		 804 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.22 
 
 		 786 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.71 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  24.2 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  23.51 
 
 		 788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.37 
 
 		 786 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.37 
 
 		 786 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  25.49 
 
 		 779 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  23.69 
 
 		 828 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  25 
 
 		 760 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  25.04 
 
 		 793 aa  140  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  23.82 
 
 		 780 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  22.29 
 
 		 767 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  24.5 
 
 		 805 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.55 
 
 		 786 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  24.15 
 
 		 763 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  23.89 
 
 		 788 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  23.47 
 
 		 785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  24.59 
 
 		 806 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  22.62 
 
 		 796 aa  134  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  22.42 
 
 		 824 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.65 
 
 		 830 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  24.18 
 
 		 826 aa  133  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  26.33 
 
 		 802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.65 
 
 		 830 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  23.02 
 
 		 783 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  24.31 
 
 		 818 aa  130  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  22.87 
 
 		 783 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  22.01 
 
 		 828 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  25.7 
 
 		 805 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  24.37 
 
 		 792 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  23 
 
 		 801 aa  129  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  23.34 
 
 		 757 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  23.34 
 
 		 757 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  24.37 
 
 		 793 aa  128  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.79 
 
 		 803 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.68 
 
 		 798 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  22.45 
 
 		 820 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  22.62 
 
 		 771 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  23.38 
 
 		 792 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.83 
 
 		 857 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>