More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1992 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1992  OmpA family protein  100 
 
 		 452 aa  923    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  26.32 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2148  OmpA family protein  38.21 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.92 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.18 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  35.22 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.69 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36.89 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.71 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  38.79 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  36.15 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.59 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.45 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.79 
 
 		 620 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.45 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.82 
 
 		 670 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.89 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.16 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 510 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 263 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 231 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  34.95 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.61 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  35.59 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 		 263 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.35 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.94 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  31.78 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.48 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.45 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  34.95 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.74 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1987 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  31.09 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 214 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  36.63 
 
 		 212 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  32.03 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 		 221 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 638 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 575 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  38.1 
 
 		 214 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.25 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.15 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  33.61 
 
 		 653 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  34.17 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0166  outer membrane protein  24.58 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000251443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  34.17 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  44.05 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  34.17 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.17 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>