295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1298 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  33.99 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
242 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
417 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  24.31 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.81 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.41 
 
 
487 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.91 
 
 
141 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  25.85 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
223 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 
265 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  25.85 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  28.18 
 
 
265 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  27.74 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  25.85 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 
357 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  27.21 
 
 
154 aa  57.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 
224 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 
229 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
232 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 
251 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
228 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  23.02 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
243 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 
227 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  27.2 
 
 
734 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.7 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0420  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
255 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554509  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.32 
 
 
220 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.45 
 
 
225 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  24.16 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
419 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.56 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.45 
 
 
146 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  23.53 
 
 
563 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.24 
 
 
225 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  21.83 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
241 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.63 
 
 
246 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
503 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.31 
 
 
240 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  29.07 
 
 
275 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
229 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  25.6 
 
 
482 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  21.23 
 
 
570 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
229 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  25.35 
 
 
154 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.23 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.76 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.25 
 
 
605 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  24.26 
 
 
435 aa  51.6  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  22.52 
 
 
747 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
229 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
228 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  28.97 
 
 
263 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
224 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 
236 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 
350 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  32.1 
 
 
308 aa  50.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
876 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
228 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 
467 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  33.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
263 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  24.14 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  22.58 
 
 
489 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
238 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.47 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  21.93 
 
 
369 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  32.41 
 
 
441 aa  50.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
232 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.65 
 
 
253 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.93 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.93 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.49 
 
 
227 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  22.66 
 
 
449 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00758  putative transcriptional regulator (Crp family) protein  28 
 
 
223 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>