218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0150 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  81.05 
 
 		 248 aa  380  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  68.2 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  53.88 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  54.63 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  53.74 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  40.91 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  45.62 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  43.46 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  43.5 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  43.67 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  39.29 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  37.44 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  37.44 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  39.83 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  37.34 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  35.93 
 
 		 265 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  37.18 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  34.71 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  34.07 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  34.71 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30.98 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  33.12 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.72 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  23.89 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  34.23 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  31.52 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  36.24 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  24.02 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  34.64 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 		 281 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>