More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0258 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  289  9e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  67.65 
 
 
156 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24671  hypothetical protein  69 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  50.86 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  46.73 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  46.73 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  42.99 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  39.74 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  48.48 
 
 
973 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  43.86 
 
 
745 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
517 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.22 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 
1033 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.5 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
256 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.15 
 
 
259 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  51.85 
 
 
261 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  51.85 
 
 
261 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  44.79 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.43 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  49.37 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
446 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  42.34 
 
 
255 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  44.26 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.53 
 
 
213 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 
438 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 
514 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  53.62 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  36.94 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  45.05 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  45.87 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  38.71 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  45.1 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  52.05 
 
 
903 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  38.68 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
447 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  41.9 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  51.76 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
497 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.83 
 
 
900 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.79 
 
 
381 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  51.95 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  51.95 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  46.08 
 
 
442 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.41 
 
 
351 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  45.88 
 
 
267 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  57.97 
 
 
273 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  54.17 
 
 
266 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.33 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  51.47 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1884  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000561383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.52 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.82 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  43.68 
 
 
824 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0814566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  40.19 
 
 
386 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  43.24 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  46 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
567 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  45.37 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  41.12 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  41.75 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  41.6 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  38.24 
 
 
600 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  40.37 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  60.29 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  37.6 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 
412 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
315 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  37.6 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 
389 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.24 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  46.85 
 
 
299 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  40.19 
 
 
1901 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 
401 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
336 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>