More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1884 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1884  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
106 aa  212  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000561383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  61.11 
 
 
108 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  61.11 
 
 
108 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0814566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  44 
 
 
319 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  42.16 
 
 
267 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 
830 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  43 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  43 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 
830 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.12 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  42.06 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  50.54 
 
 
517 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  45.1 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  43.81 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 
315 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 
540 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  41.84 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  52.11 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  39.77 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  43.16 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  46.43 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.68 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  48.15 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  49.37 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  47.56 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
824 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  41.94 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44.79 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  40.2 
 
 
309 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
195 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 
231 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 
237 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  48.28 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1320  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  49.3 
 
 
343 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
256 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 
949 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 
260 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  49.3 
 
 
343 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  39.56 
 
 
315 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.6 
 
 
184 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
1033 aa  62  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.6 
 
 
294 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.9 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  41.3 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  37.96 
 
 
223 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  46.58 
 
 
331 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
234 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
234 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1117  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  43.01 
 
 
446 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  44.71 
 
 
213 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  40.45 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
567 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  38 
 
 
533 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  51.35 
 
 
576 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
259 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  49.3 
 
 
241 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  46.07 
 
 
267 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
261 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  45.24 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.14 
 
 
537 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 
213 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.05 
 
 
277 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
266 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.1 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.5 
 
 
525 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
261 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 
336 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 
900 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 
336 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4190  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
333 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  33.67 
 
 
866 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 
416 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  42.71 
 
 
401 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  42.71 
 
 
401 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 
521 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
493 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 
418 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  40.7 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>