More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3935 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  50.74 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  53.2 
 
 		 204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  53.73 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  53.73 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  53.73 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  54.23 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  48.85 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  53.23 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  53.23 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  53.23 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  52.24 
 
 		 204 aa  210  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.23 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  49.75 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  51.24 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  50.99 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  52.3 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  42.65 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  38.54 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  35.26 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.97 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  29.35 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.88 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  27.45 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.21 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  28.92 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.96 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  28.8 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  29.35 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  32.42 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.35 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  29.19 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.31 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.64 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.02 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  28 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  29.84 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  28.11 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  30.43 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  26.18 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  26.04 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  29.35 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  26.79 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  30.21 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  25.49 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  28.5 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  27.75 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.27 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  26.88 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  26.84 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  27.22 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  26.79 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.38 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  29.95 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.92 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  26.11 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  24.51 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  26.11 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  25.56 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  25.98 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.06 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  27.13 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  26.84 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  26.92 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  25.56 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  27.41 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  25.56 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  26.21 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  26.52 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.79 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  27.87 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  24.5 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>