More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4238 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  100 
 
 		 345 aa  700    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.51 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.44 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.08 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  32.56 
 
 		 354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  38.28 
 
 		 355 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 328 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  29.03 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  42.01 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  42.01 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.06 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  34.08 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  34.13 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.72 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 		 363 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.87 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.27 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.57 
 
 		 363 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  39.8 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  28.85 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.26 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.53 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  36.22 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.17 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.56 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  27.53 
 
 		 439 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  33.47 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  30.03 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.52 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.27 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  31.62 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.28 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  26.4 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  30.96 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  26.4 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  26.4 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  35.38 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.03 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.29 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.48 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  31.9 
 
 		 361 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  29.94 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  29.94 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.2 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.85 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.2 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.83 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.62 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.93 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  25.54 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  31.38 
 
 		 3337 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  28.11 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.16 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  29.94 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.17 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  35.36 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  29.82 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  31.25 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.57 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28.89 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.49 
 
 		 333 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.86 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  34.81 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.35 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.07 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  30.59 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  36.92 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  30.3 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  34.07 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  26.56 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  38.65 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  30.24 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  28.13 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  35.19 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.62 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.87 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.67 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  37.71 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  26.01 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  32.66 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  39.88 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  25.43 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  26.96 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  39.88 
 
 		 283 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>