More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1172 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1172  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3406  OmpA/MotB domain-containing protein  69.6 
 
 		 291 aa  387  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2725  OmpA/MotB  62.42 
 
 		 294 aa  358  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.62 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.26 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.26 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.45 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  34.03 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.71 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.59 
 
 		 707 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  42.45 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  54.93 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.4 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.69 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  39.13 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  41.12 
 
 		 640 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.32 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  35.96 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  43.27 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.06 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  37.82 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  52.11 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  52.11 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  52.11 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.25 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  33.12 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.32 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.32 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36.75 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.87 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.25 
 
 		 694 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.42 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.29 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  49.32 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.26 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  49.3 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  49.3 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  49.3 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  36.04 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  50.7 
 
 		 220 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.94 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  40.18 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>