More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 568 aa  1112    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 		 590 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  47.17 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  47.17 
 
 		 602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  47.44 
 
 		 592 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  47.08 
 
 		 590 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  46.55 
 
 		 595 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 		 595 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  46.62 
 
 		 596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  46.17 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  46.85 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 595 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 602 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 588 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 588 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 588 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  42.68 
 
 		 543 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  41.65 
 
 		 538 aa  332  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  47.7 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  46.21 
 
 		 316 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  46.83 
 
 		 310 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  47.21 
 
 		 320 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  46.1 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  45.76 
 
 		 317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  45.76 
 
 		 317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  45.76 
 
 		 317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 311 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  45.76 
 
 		 317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 		 303 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  47.44 
 
 		 315 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 312 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 312 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  45.26 
 
 		 307 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 312 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  46.98 
 
 		 321 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  46.98 
 
 		 316 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  46.08 
 
 		 298 aa  209  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  43.11 
 
 		 293 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  40.75 
 
 		 345 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 342 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 		 342 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 290 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.47 
 
 		 295 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 277 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 295 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 267 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  37.89 
 
 		 276 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  38.64 
 
 		 287 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  42.08 
 
 		 292 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 279 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 284 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 284 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 284 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  41.87 
 
 		 301 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 		 290 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  40.91 
 
 		 289 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 263 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 		 302 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 278 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 300 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 300 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 300 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 300 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 296 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.38 
 
 		 302 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.38 
 
 		 302 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.38 
 
 		 302 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.38 
 
 		 302 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 280 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 274 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 274 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 274 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 308 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>