155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  834    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  56.37 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  42.24 
 
 		 432 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  41.93 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  40.96 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  43.71 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  40.34 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  40.29 
 
 		 431 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  40.28 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  36.56 
 
 		 564 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  41.33 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  35.84 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  40.24 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  37.36 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  37.97 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  38.29 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  27.87 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.49 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  34.13 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  36.24 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.74 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  24.21 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  36.78 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  27.71 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.02 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  30.47 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  35.43 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  27.32 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.61 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.39 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  32.18 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  35.5 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  30.81 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.23 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  25.53 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  31.98 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.47 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  24.21 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  32.2 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  30.09 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  28.09 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  32.74 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  30.39 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  35.76 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  22.22 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  28.24 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  29.93 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  27.63 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  22.22 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  25.51 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  27.89 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  28.31 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.21 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  27.45 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  28.99 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  21.54 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.08 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  30.1 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  27.21 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  24.84 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 552 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  26.91 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  29.75 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  30.99 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  19.54 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  29.1 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.23 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.47 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  30.19 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.47 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.14 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  25.19 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  28.25 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  28.47 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.83 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  24.09 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  28.25 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  29.1 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.6 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.47 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.14 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.05 
 
 		 297 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 		 302 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  22.49 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>