205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  100 
 
 
678 aa  1357    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  40.09 
 
 
725 aa  492  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  38.82 
 
 
757 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  43.31 
 
 
727 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  36.97 
 
 
712 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  39.84 
 
 
743 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  38.16 
 
 
751 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  35.73 
 
 
772 aa  353  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  34.13 
 
 
734 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  32.99 
 
 
884 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  35.78 
 
 
800 aa  316  8e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  37.04 
 
 
911 aa  275  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  24.57 
 
 
847 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.74 
 
 
497 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  22.75 
 
 
896 aa  86.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.12 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.8 
 
 
544 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.11 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  36.07 
 
 
559 aa  73.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.18 
 
 
539 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  40.95 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  33.58 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  35.29 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  29.12 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  37.5 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  39.64 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.69 
 
 
563 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.54 
 
 
495 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  22.19 
 
 
575 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  32.12 
 
 
468 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.85 
 
 
551 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  29.15 
 
 
578 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.08 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  32.03 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  40.91 
 
 
468 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  28.12 
 
 
473 aa  63.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  39.77 
 
 
468 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  37.61 
 
 
512 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  32.03 
 
 
447 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  39.77 
 
 
468 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  39.77 
 
 
468 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  38.24 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  39.77 
 
 
468 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  39.77 
 
 
469 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  34.46 
 
 
523 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  38.64 
 
 
468 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  39.77 
 
 
481 aa  61.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.78 
 
 
549 aa  60.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.26 
 
 
552 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.26 
 
 
552 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  41.58 
 
 
534 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  28.51 
 
 
481 aa  60.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  23.04 
 
 
550 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.43 
 
 
512 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.05 
 
 
552 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 
483 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  38.64 
 
 
468 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.25 
 
 
537 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  38.32 
 
 
334 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  37.86 
 
 
472 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  25.23 
 
 
463 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  33.33 
 
 
466 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  33.33 
 
 
477 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  28.41 
 
 
472 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  35.04 
 
 
338 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.77 
 
 
549 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  36.54 
 
 
414 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  39.67 
 
 
417 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  39.67 
 
 
417 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
417 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.23 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
417 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  29.89 
 
 
458 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  37.8 
 
 
454 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  26.22 
 
 
529 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  29.45 
 
 
548 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  38.02 
 
 
417 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  27.01 
 
 
937 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0158707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  29.63 
 
 
771 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  36.56 
 
 
501 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.17 
 
 
541 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.17 
 
 
541 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.3 
 
 
775 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.52 
 
 
677 aa  53.9  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  38.02 
 
 
408 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  38.02 
 
 
408 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  36.36 
 
 
417 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  26.91 
 
 
539 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  26.29 
 
 
557 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  38.02 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  38.24 
 
 
548 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  37.5 
 
 
469 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  22.79 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.54 
 
 
579 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  30.58 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  25.82 
 
 
557 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  38.02 
 
 
384 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  38.02 
 
 
384 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  33.33 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  37.19 
 
 
408 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>