More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2650 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2650  ABC transporter related  100 
 
 		 494 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137858  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2076  ABC transporter related  83.3 
 
 		 514 aa  679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1042  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39 
 
 		 582 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  39.02 
 
 		 538 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  38.1 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.33 
 
 		 525 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  36.66 
 
 		 540 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  36.51 
 
 		 554 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  36.95 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  38.37 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  35.05 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  36.01 
 
 		 543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  31.78 
 
 		 543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  33.73 
 
 		 606 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  36.56 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  38.74 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 		 536 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  36.21 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  36.72 
 
 		 536 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  38.48 
 
 		 548 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  38.69 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  35.15 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  34.41 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  35.21 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  35.47 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  33.67 
 
 		 613 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  38.43 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  34.29 
 
 		 534 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  35.69 
 
 		 603 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 543 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.61 
 
 		 536 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  36.33 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  36.14 
 
 		 543 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 614 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  35.83 
 
 		 546 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.59 
 
 		 594 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2178  ABC transporter-like  33.82 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  37.5 
 
 		 557 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  34.18 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  34.98 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  34.16 
 
 		 524 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 614 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  36.57 
 
 		 665 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  36.5 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  36.27 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  35.46 
 
 		 565 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  36.81 
 
 		 527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 607 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.9 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  36.38 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  35.74 
 
 		 624 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  36.03 
 
 		 537 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  36.25 
 
 		 544 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  33.98 
 
 		 542 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  34.27 
 
 		 535 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  35.26 
 
 		 552 aa  200  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  35.74 
 
 		 624 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  36.35 
 
 		 537 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  37.23 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  34.88 
 
 		 585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  33.78 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  35.7 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  32.73 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  35.41 
 
 		 558 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  34.79 
 
 		 527 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2140  ATPase  37.25 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  35.67 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  35.9 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  35.8 
 
 		 621 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  34.58 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  34.34 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  34.64 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  37.95 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  33.2 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  35.54 
 
 		 624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 		 527 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  35.32 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  39.22 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  39.22 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  39.22 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  33.13 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  34.7 
 
 		 613 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  35.52 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  35.67 
 
 		 624 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 546 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  36.16 
 
 		 540 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  34.08 
 
 		 566 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  36.19 
 
 		 559 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 565 aa  196  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  31.87 
 
 		 571 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  36.48 
 
 		 608 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>