More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2409 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 421 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 420 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  38.25 
 
 		 414 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 425 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 435 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.46 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 467 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  38.34 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  41.57 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 420 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 461 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  37.28 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.84 
 
 		 418 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  31.56 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  31.56 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  31.56 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  31.56 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  31.56 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 433 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  36.07 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.03 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  28.13 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  28.13 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  28.13 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 439 aa  99.8  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  30.41 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 451 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.31 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.89 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.05 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.86 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.83 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.84 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 421 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  27.93 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  28.81 
 
 		 530 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  28.84 
 
 		 557 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.57 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.57 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.57 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  26.59 
 
 		 553 aa  86.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>