More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1529 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1529  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 378 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.456691  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1471  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  75.22 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284694  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  33.7 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  34.41 
 
 		 459 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  34.05 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  37.87 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  37.87 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.67 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  39.1 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 		 507 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  34.83 
 
 		 514 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.57 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.83 
 
 		 475 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  34.83 
 
 		 514 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.95 
 
 		 487 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.83 
 
 		 674 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.56 
 
 		 485 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.57 
 
 		 415 aa  86.3  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.96 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.47 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  35.06 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  34.5 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  38.82 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.82 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.66 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.82 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.33 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.36 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.36 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.78 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  35.33 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.33 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  36.18 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.33 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  36.18 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  36.18 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.33 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  35.33 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  35.33 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  33.65 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.33 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  34.67 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.07 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.99 
 
 		 537 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  35.86 
 
 		 597 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  36.78 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.12 
 
 		 515 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  35.88 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  36.13 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.5 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.82 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  33.73 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  33.73 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  33.73 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  33.73 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  33.73 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  35.1 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  39.86 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  38.33 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  37.82 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  35.29 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  34.52 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  34.13 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  34 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.67 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.8 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  34.55 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2314  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.91 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  34.52 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.45 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.96 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  34.48 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.88 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1153  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.13 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.657574  normal  0.225751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.21 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  31.36 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  35.12 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  33.52 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  35.67 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  35.03 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  34.67 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  38.41 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>