More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0762 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0762  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  610  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0704  inner-membrane translocator  91.45 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0207782  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2848  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.525645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.91 
 
 		 656 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.07 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  26.73 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  29.34 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  27.15 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  33.56 
 
 		 341 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 439 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  30 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 415 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  25.18 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  31.62 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  28.36 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  29.47 
 
 		 852 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.07 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3185  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0943  inner-membrane translocator  27.02 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1228  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0580355  normal  0.0656558 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.8 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3477  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783038  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3690  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00194124  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1331  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1046  inner-membrane translocator  25.73 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4008  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.41 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1905  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  30.26 
 
 		 628 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  25.74 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>