More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0347 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  801    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  82.06 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  58.94 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  59.41 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  49.05 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  46.12 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.41 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  40.38 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.97 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  33.97 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.69 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.69 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.69 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.69 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.23 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  27.6 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.59 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.02 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.39 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.39 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.39 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.71 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  24.2 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  26.3 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  27.07 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  27.59 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.05 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  26.08 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.79 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.75 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.61 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  26.39 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  28.16 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.46 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.34 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>