More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3137 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  90.57 
 
 		 265 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  84.41 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  86.15 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  77.87 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  76.06 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  76.77 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  75.98 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  74.13 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  74.52 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  74.22 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  74.52 
 
 		 275 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  74.61 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  70.59 
 
 		 274 aa  370  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  60.56 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  62.6 
 
 		 260 aa  314  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  60.32 
 
 		 270 aa  311  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  58.17 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  58.27 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.87 
 
 		 279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  60.24 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  57.87 
 
 		 274 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  59.13 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  59.92 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  59.52 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  59.92 
 
 		 261 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  58.33 
 
 		 306 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  59.92 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  59.13 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  57.71 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  58.66 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  59.52 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  58.73 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  58 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  57.77 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  56.92 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  59.13 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  54.23 
 
 		 277 aa  291  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  52.42 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  55.78 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  56.57 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  54.51 
 
 		 272 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  51.32 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.31 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  53.44 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  54.8 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  52.9 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  53.36 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  54.51 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  58.33 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  55.38 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  54.15 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  51.39 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  48.62 
 
 		 283 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.88 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  46.85 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  47.45 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  47.27 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  47.22 
 
 		 253 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  48.03 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  49.01 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  44.65 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  48.02 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.02 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  44.49 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 		 305 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  44.88 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  44.19 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  44.49 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.8 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  42.08 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  46.06 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  40.93 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.31 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  41.2 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.15 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.41 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  44.49 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>