More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5143 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  43.24 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  37.79 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  28.02 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.73 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  35.09 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2924  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  32.78 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  34.34 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  29.52 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  28.31 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  34.27 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  32.98 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  30.51 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.94 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  33.5 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.41 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  31.95 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.38 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>