More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4519 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  100 
 
 		 451 aa  884    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  71.18 
 
 		 450 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  64.73 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  56.77 
 
 		 467 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  57.37 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  52.9 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  55.34 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  44.92 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  36.55 
 
 		 447 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.04 
 
 		 460 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.08 
 
 		 595 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.45 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.54 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  29.28 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.85 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.13 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  30.19 
 
 		 475 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.52 
 
 		 593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  31.23 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  30.77 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.01 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.2 
 
 		 681 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.78 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.67 
 
 		 550 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.29 
 
 		 603 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.58 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.64 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.26 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.21 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.27 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.68 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.32 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.16 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.62 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.32 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.44 
 
 		 611 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  32.92 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  30.6 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.9 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.57 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.05 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.32 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  31.7 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.19 
 
 		 601 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.9 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  34.66 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  30.72 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.48 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.94 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.3 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  28.47 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  30 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  31.3 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.3 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.34 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  31.3 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  31.3 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  30.86 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.57 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.04 
 
 		 388 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.04 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.04 
 
 		 388 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.75 
 
 		 513 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.69 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.14 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  24.77 
 
 		 559 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  29.52 
 
 		 650 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.68 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  30.29 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  25.84 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.3 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.29 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.29 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.96 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.42 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.04 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.48 
 
 		 524 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.36 
 
 		 521 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.16 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.57 
 
 		 578 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.13 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  33.56 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.24 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.74 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.07 
 
 		 475 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  24.18 
 
 		 1032 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.29 
 
 		 567 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  23.39 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.54 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.71 
 
 		 669 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  28.62 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.52 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25.95 
 
 		 616 aa  97.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.69 
 
 		 364 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  28.62 
 
 		 580 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.53 
 
 		 720 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.29 
 
 		 505 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.13 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.4 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.97 
 
 		 508 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>