More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4239 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  75.66 
 
 
268 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.25 
 
 
268 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
261 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  48.88 
 
 
262 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
262 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  48.3 
 
 
260 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
260 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
259 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
262 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
261 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
264 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
264 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
262 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
260 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
261 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
261 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  36 
 
 
260 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
260 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
259 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
259 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
294 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
259 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
259 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
263 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
257 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
259 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
259 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
262 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
259 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
259 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  35.88 
 
 
255 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  34.44 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.21 
 
 
261 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.06 
 
 
261 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
249 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.21 
 
 
261 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
270 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.19 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  35.63 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.45 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
256 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
256 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0400  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0215607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  35.14 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.42 
 
 
268 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.85 
 
 
281 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.07 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.84 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.436635  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.21 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.37 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.59 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
255 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1057  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  35.09 
 
 
245 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
259 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
245 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.73 
 
 
261 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>