More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2769 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2769  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3857  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3260  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3605  hypothetical protein  37.32 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4655  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6108  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2097  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4017  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2236  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3538  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.847123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2386  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1945  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.140047  hitchhiker  0.000477729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4935  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  27.84 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  24.46 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2362  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1116  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2992  helix-turn-helix domain-containing protein  24.49 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0239813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1834  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.73118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2709  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2106  hypothetical protein  26.23 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.89932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5971  transcriptional regulator, AraC family  22.3 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.965071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  21.45 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1200  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  24.03 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5541  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0640  pobR protein  25 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2448  AraC family transcription regulator  25.86 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5549  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0297  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  23.31 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3242  helix-turn-helix domain-containing protein  24.23 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2435  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.996011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6334  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3473  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1558  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1732  AraC family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2572  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1401  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0891461  normal  0.79487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0805  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5673  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.48691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0633  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  25.29 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04223  HpaA  35.35 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3709  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.680131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04189  hypothetical protein  35.35 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4577  4-hydroxyphenylacetate catabolism regulatory protein HpaA  35.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14410  Transcriptional regulator PobR (AraC family)  25.1 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1302  transcriptional regulator, AraC family  21.66 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2696  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5021  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03070  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00675677  hitchhiker  0.00000142232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0706  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4620  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07776  putative AraC family transcriptional regulatory protein  29.14 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.15612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3180  helix-turn-helix domain-containing protein  24.28 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3383  transcriptional regulator, AraC family  21.12 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0398401  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2298  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000152227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0334  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  23.7 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3388  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3306  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4030  helix-turn-helix domain-containing protein  22.09 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>