265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1245 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  55.42 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  57.5 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  60 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  59.58 
 
 		 240 aa  284  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  59.17 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  59.17 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  59.17 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  59.17 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  59.17 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  59.17 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  59.17 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  56.25 
 
 		 257 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  58.75 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  57.92 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  57.92 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  57.92 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  57.92 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  57.5 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  58.33 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  53.75 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  55 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  49.39 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  52.08 
 
 		 239 aa  248  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  52.5 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  45.08 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  46.09 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  46.8 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  44.8 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  38.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  40.32 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  40.32 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.92 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  39.92 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.92 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  39.92 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  39.92 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  39.92 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  40 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.92 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  39.92 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  37.14 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  37.65 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  34.41 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  34.41 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  36.99 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  35.43 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  35.32 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  37.01 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  38.64 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  35.94 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  37.65 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  34.25 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  34.14 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  34.38 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  34.65 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  41.26 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 		 285 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  33.73 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  33.47 
 
 		 284 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  33.33 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  33.78 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  35.32 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  36.51 
 
 		 316 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  33.06 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  32.63 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  35.74 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  38.53 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  33.68 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  33.63 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  31.38 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  33.18 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  31.75 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  30.49 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.11 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  33.47 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  26.91 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  27.02 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  29.38 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  29.81 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.78 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.44 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.68 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.06 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.59 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.15 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.61 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  35.06 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.42 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  30.59 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.23 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.64 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.43 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.41 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.98 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.68 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  34.34 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>