More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6336 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6336  Cytochrome P450-like protein  100 
 
 
381 aa  743    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5343  cytochrome P-450  59.48 
 
 
385 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  31.81 
 
 
391 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.29 
 
 
426 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  30.32 
 
 
416 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2327  cytochrome P450-like protein  30.05 
 
 
408 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.283522  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  33.5 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  30.34 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  32.23 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  29.25 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  30.32 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  29.95 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  30.08 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  28.1 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  29.13 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  29.4 
 
 
400 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  27.61 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  30.27 
 
 
400 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  29.92 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  30.81 
 
 
406 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  27.96 
 
 
407 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.38 
 
 
411 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  29.26 
 
 
405 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  31.35 
 
 
402 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  30.31 
 
 
406 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  28.9 
 
 
402 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  28.27 
 
 
408 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  28.95 
 
 
410 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  29.07 
 
 
409 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  27.97 
 
 
412 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  28.42 
 
 
403 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  28.11 
 
 
408 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  31.35 
 
 
398 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  29.35 
 
 
401 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  27.58 
 
 
401 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  29.4 
 
 
412 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  27.72 
 
 
400 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  29.04 
 
 
422 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  30.29 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  29.34 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  27.39 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  27.15 
 
 
421 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  27.47 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  32.41 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  28.28 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  29.71 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  24.94 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  30.59 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  29.95 
 
 
425 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  27.57 
 
 
397 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  27.81 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  28.41 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  28.41 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  28.41 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  30.41 
 
 
399 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  26.98 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  30.63 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  27.94 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  27.74 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  29.97 
 
 
401 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  29.2 
 
 
436 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  27.87 
 
 
394 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  28.35 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  27.57 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  25.97 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  28.15 
 
 
393 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  29.4 
 
 
423 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  28.24 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  29.27 
 
 
421 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  26.53 
 
 
409 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  28.3 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  27.66 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  27.71 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  29.2 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  26.5 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  26.91 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  29.18 
 
 
435 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  26.94 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  29.98 
 
 
421 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  29.68 
 
 
412 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  30.48 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  27.75 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  26.47 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  28.17 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  32.36 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  27.13 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  28.88 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4984  cytochrome P450  27.2 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  29.35 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  28.42 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  27.93 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  26.65 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  27.89 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  28.06 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  25.85 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  25.89 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  25.53 
 
 
428 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  27.2 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  30.51 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  27.95 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>