More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4706 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  34.95 
 
 
405 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  34.95 
 
 
405 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  35.99 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  36.39 
 
 
414 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  33.97 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  31.91 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  31.91 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  31.91 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  34.29 
 
 
404 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.02 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  36.05 
 
 
399 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  31.47 
 
 
413 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  32.19 
 
 
426 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  36.33 
 
 
399 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  32.87 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  33.61 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  37.62 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.83 
 
 
405 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.11 
 
 
398 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.69 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.48 
 
 
398 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.84 
 
 
412 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.74 
 
 
401 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  34.48 
 
 
399 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  33.51 
 
 
399 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  32.57 
 
 
421 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  32.66 
 
 
404 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  32.66 
 
 
404 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  32.66 
 
 
404 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.43 
 
 
399 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3390  cytochrome P450  34.94 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  35.19 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.09 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.46 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2279  cytochrome P450  35.33 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.430485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.08 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.01 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  36.19 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.6 
 
 
408 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.9 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.86 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.59 
 
 
401 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  31.55 
 
 
387 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.63 
 
 
401 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.16 
 
 
405 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  34.64 
 
 
418 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.39 
 
 
404 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.75 
 
 
395 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  36.26 
 
 
434 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  34.9 
 
 
428 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.64 
 
 
407 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.41 
 
 
400 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.66 
 
 
407 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.53 
 
 
380 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.22 
 
 
394 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.66 
 
 
407 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37 
 
 
419 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.97 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  32.1 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  34.74 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  36.75 
 
 
406 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.8 
 
 
402 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.75 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.5 
 
 
409 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  32.07 
 
 
398 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.11 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.11 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.54 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.11 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  33.12 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.11 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.48 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  33.44 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  32.66 
 
 
408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  30.68 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  33.97 
 
 
427 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.44 
 
 
392 aa  163  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.06 
 
 
398 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.42 
 
 
423 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  33.97 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  33.97 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.88 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.15 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.54 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.43 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  37.01 
 
 
405 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  31.55 
 
 
408 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.07 
 
 
405 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.03 
 
 
418 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  35.02 
 
 
399 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.88 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  36.39 
 
 
387 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.88 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  31.14 
 
 
420 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  30.26 
 
 
412 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  31.82 
 
 
408 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.18 
 
 
398 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.88 
 
 
411 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>