More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5951 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  100 
 
 		 558 aa  1108    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 554 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  55.1 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  52.8 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 536 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  51.19 
 
 		 541 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  50.82 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  50.82 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  52.17 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  50.82 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  47.47 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 544 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  48.33 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  47.64 
 
 		 565 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 535 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  43.06 
 
 		 531 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 530 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  41.01 
 
 		 530 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  35.09 
 
 		 534 aa  321  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  38.21 
 
 		 527 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  38.6 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  37 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  33.46 
 
 		 529 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 536 aa  306  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  38.89 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.72 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  32.78 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.28 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  37.57 
 
 		 531 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  39.36 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  37.3 
 
 		 535 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  33.33 
 
 		 529 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  32.3 
 
 		 530 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  31.66 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.59 
 
 		 546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  36.16 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  35.28 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  34.91 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.23 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.88 
 
 		 548 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.39 
 
 		 530 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  36.85 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  35.09 
 
 		 545 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.5 
 
 		 541 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.94 
 
 		 551 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.94 
 
 		 551 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  34.95 
 
 		 524 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  35.92 
 
 		 532 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 524 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  34.98 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  34.62 
 
 		 525 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.03 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.9 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.16 
 
 		 523 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.43 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.03 
 
 		 646 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  28.55 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.66 
 
 		 638 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  32.92 
 
 		 645 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  31.89 
 
 		 627 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  32.29 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.68 
 
 		 668 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  30.76 
 
 		 656 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.91 
 
 		 643 aa  196  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  30.04 
 
 		 519 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.22 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.67 
 
 		 545 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.02 
 
 		 627 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  31.75 
 
 		 625 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  30.39 
 
 		 627 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.04 
 
 		 639 aa  194  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  29.5 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  31.65 
 
 		 537 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.66 
 
 		 620 aa  193  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  31.62 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  31.97 
 
 		 625 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.82 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  31.26 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  31.26 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.87 
 
 		 690 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  31.37 
 
 		 627 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.91 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 640 aa  190  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.96 
 
 		 685 aa  189  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>