More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5135 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  68.23 
 
 		 390 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  59.9 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  57.4 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  54.31 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  55.87 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  54.15 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  51.93 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  58.68 
 
 		 405 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  52.13 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  53.72 
 
 		 227 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.5 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 		 425 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  27.02 
 
 		 455 aa  123  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  28.39 
 
 		 444 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  27.96 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 435 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  24.27 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  24.27 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  28.78 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  35.9 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.08 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  27.17 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  34.34 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.31 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  33.95 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 500 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  30.03 
 
 		 474 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  31.91 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  38.01 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.11 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.91 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  27.3 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 		 340 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.67 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  23.96 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  35.98 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.72 
 
 		 312 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.42 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  26.77 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.14 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3772  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  32.67 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.39 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  20.17 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.27 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  31.43 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.06 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  35.26 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.12 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 463 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.72 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.85 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>