169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4665 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  43.82 
 
 
272 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  43.82 
 
 
286 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  35.2 
 
 
303 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  34.85 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  38.89 
 
 
324 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  35.47 
 
 
290 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  36.93 
 
 
264 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  37.15 
 
 
256 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  34.45 
 
 
304 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  36.65 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  35.89 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  34.29 
 
 
292 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  30.58 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  35.39 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  38.21 
 
 
319 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  31.49 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  31.23 
 
 
280 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  33.06 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  32.79 
 
 
303 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  33.48 
 
 
305 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  35.37 
 
 
246 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  32.03 
 
 
270 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  32.03 
 
 
270 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  32.03 
 
 
270 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  30.23 
 
 
271 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.57 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  32.28 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  32.71 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  31.73 
 
 
345 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  31.03 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  33.92 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  31.3 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  33.04 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  32.53 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  33.04 
 
 
237 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  33.04 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  31.67 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  31.08 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  32.02 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  32.02 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  30.95 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  31.42 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  30.74 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  31.14 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  32.29 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  30.36 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.78 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  29.27 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  29.01 
 
 
293 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  31.72 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  31.7 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  31.56 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  31.22 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  31.91 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.52 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.12 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  30.12 
 
 
311 aa  75.1  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  27.39 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.27 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  28.23 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.64 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  33.62 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  28.81 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  29 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.57 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  28.74 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  26.88 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  31.2 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.92 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  30.99 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  36.22 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  26.94 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  30.32 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  30.19 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.02 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  37.11 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  35.5 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  27.85 
 
 
213 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.6 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  25.31 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  26.61 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  29.52 
 
 
311 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  27.14 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  26.24 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  34.45 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.07 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.32 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.97 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  26.58 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  25.51 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  25.88 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  31.54 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>