123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2855 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 483 aa  976    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  35.29 
 
 		 487 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  37.66 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 467 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  36.27 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.95 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.66 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 472 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.51 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.51 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 442 aa  93.2  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  24.66 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.87 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  32.67 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.54 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.24 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.06 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  26.88 
 
 		 618 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.67 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.1 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 418 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 435 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.85 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  46.15 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  20.53 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.2 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  41.03 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 413 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.21 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.7 
 
 		 439 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.18 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.6 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.03 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 488 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  19.8 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.36 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.48 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 399 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  46.15 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>