243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0194 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 419 aa  825    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  37.63 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.92 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.16 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  33.44 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.53 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  35.54 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.46 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.68 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  27.68 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.48 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  34.52 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.62 
 
 		 723 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.17 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.51 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.62 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  33.96 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  29.75 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.08 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28.06 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  32.27 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  29.18 
 
 		 891 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.11 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  34 
 
 		 756 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.52 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.55 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  27.91 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.74 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.17 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  26.87 
 
 		 912 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.73 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  27.75 
 
 		 904 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  28.1 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  27.52 
 
 		 904 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.95 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  28.17 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  28.17 
 
 		 894 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 		 896 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.3 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  34.27 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  29.03 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  29.03 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.86 
 
 		 900 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.86 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.86 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.81 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.91 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  24.46 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.98 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.99 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  30.1 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.26 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.63 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.81 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  28.05 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  34.03 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  28.42 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  30.73 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  25.87 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.15 
 
 		 1109 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.37 
 
 		 1033 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.1 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0466  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  27.88 
 
 		 1862 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.86 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.76 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  29.39 
 
 		 1063 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.75 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4238  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  29.23 
 
 		 1827 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.83 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1606  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding protein  29.55 
 
 		 1827 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  23.66 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  28.02 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26.03 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2521  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  31.27 
 
 		 1832 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  22.87 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.1 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.78 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.1 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1914  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  36.96 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.91 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1457  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1109 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  29.82 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1119  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  29.91 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  24.24 
 
 		 1147 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1109 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  27.17 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.81 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.18 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  21.52 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3077  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  53.33 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.276953  unclonable  0.0000000285564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  28.51 
 
 		 665 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1428  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  30.52 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1128  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.12 
 
 		 1068 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.6 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  30.23 
 
 		 666 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.88 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.88 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>