More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0735 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  293  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 191 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  37.31 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  36.15 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  33.06 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  34.59 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  32.35 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  32.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  36.52 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  36.52 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.23 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>