218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0262 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  72.57 
 
 		 238 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  72.12 
 
 		 238 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  63.64 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  53.45 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  52.84 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  51.04 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  51.04 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  50.42 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  49.57 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  51.03 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  51.68 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  47.9 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  51.74 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  49.17 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  50.67 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  50.22 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  43.85 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  43.25 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  43.62 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  43.21 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  43.21 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  42.98 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  40 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  44.44 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  40.24 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  43.1 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  43.64 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  41.74 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  42.04 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  39.84 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  45.61 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  45.61 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  43.56 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  42 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  43.33 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  40.69 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  41.15 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  43.97 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  46.02 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  36.25 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  40.16 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  31.6 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  37.56 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  36.82 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  32.66 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  33.19 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  37.24 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.01 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.68 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  34.76 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  31.47 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  34.72 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  31.75 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  35.19 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  34.13 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  32.93 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  29.55 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  26.85 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  34.83 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  29.68 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.66 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  28.19 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.22 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.83 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  29.13 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  33.14 
 
 		 192 aa  92  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  28.7 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  28.19 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  27.92 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  28.17 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  34.57 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  28.28 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  28.32 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  29.13 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  28.43 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  28.44 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  27.93 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  28.32 
 
 		 192 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  28.04 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  27.66 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.14 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  28.42 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  33.53 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  32.37 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  32.18 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  34.71 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  30.21 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  29.75 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0077  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.461386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1713  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.640514  normal  0.230942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>