217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2117 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  60.35 
 
 		 239 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  60.35 
 
 		 239 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  58.97 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  62.01 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  54.73 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  54.36 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  42.68 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  42.23 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  44.3 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  41.04 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  41.04 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  46.88 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  43.36 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  41.37 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  41.3 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  41.23 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  42.11 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  41.13 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  42.37 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  39.76 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  40.49 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  41.74 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  40.89 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.99 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  41.37 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  37.55 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  46.77 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  42.5 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  40.57 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  40.57 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  40.56 
 
 		 344 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  47.31 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  39.43 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  43.97 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  40.76 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  45.7 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  42.54 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  42.54 
 
 		 238 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.86 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  45.7 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  39.09 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  36.98 
 
 		 229 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  38.17 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  37.63 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  32.9 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.17 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  33.51 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  34.05 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  33.51 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  27.94 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  30.77 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  33.15 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  35.67 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  27.24 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  27.56 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.72 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.88 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  27.75 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  31.18 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  26.63 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  36.31 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  26.63 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  36.94 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  31.79 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  30.05 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  25.54 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  28.73 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  27.1 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  33.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  28.73 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  33.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  30 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  28.32 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  24.9 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  34.59 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  34.59 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  34.38 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  31.68 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  33.96 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  34.39 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  30.6 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  28.34 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  31.94 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  27.61 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  32.08 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  26.99 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  28.74 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  29.09 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  27.07 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  31.58 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  31.1 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  27.61 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  24.22 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  27.86 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>