219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4294 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  98.7 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  81.82 
 
 		 231 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  81.39 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  80.52 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  80.52 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  80.26 
 
 		 237 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  78.35 
 
 		 231 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  77.31 
 
 		 237 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  72.5 
 
 		 240 aa  342  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  48.93 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  48.89 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  46.12 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  47.64 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  48.09 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  49.77 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  49.3 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  45.92 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  42.5 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  46.09 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  48.37 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  49.3 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  48.15 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  47.75 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  44.02 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  49.04 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  49.37 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  48.56 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  45.41 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  41.63 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  44.25 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  45.11 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  41.63 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  43.5 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  43.85 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  42.99 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  43.81 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3572  flagellar basal body L-ring protein  45.45 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  44.44 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  43.72 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  47.44 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  45.58 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  43.44 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  45.02 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  46.04 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  42.08 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  43.26 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  44.55 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  43.58 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  42.67 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3577  flagellar L-ring protein  43.54 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  41.45 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  39.91 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1265  flagellar L-ring protein  47.83 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01006  flagellar basal body L-ring protein  46.34 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0741742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06160  flagellar basal body L-ring protein  46.34 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479545  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  37.02 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  38.98 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  37.95 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  38.3 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  38.08 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  38.08 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0243  flagellar basal body L-ring protein  39.47 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  40.27 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24060  Flagellar L-ring protein  41.97 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  37.44 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  36.86 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0190  flagellar basal body L-ring protein  40.82 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  38.81 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  40.7 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  38.81 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1593  flagellar basal body L-ring protein  38.79 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  36.71 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2913  flagellar L-ring protein  43.55 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.58 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  36.75 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  32.43 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  36.55 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2246  flagellar basal body L-ring protein  35.39 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.229284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  39.2 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  31.42 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  34.44 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1248  flagellar basal body L-ring protein  39.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1292  flagellar basal body L-ring protein  39.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  normal  0.0113309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  33.18 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1277  flagellar basal body L-ring protein  39.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  hitchhiker  0.00216763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2008  flagellar basal body L-ring protein  39.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0259721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2192  flagellar basal body L-ring protein  39.21 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  37.07 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1666  flagellar L-ring protein  40.39 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  36.1 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2567  flagellar L-ring protein  35.98 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.089001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2521  flagellar basal body L-ring protein  35.98 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.937558  hitchhiker  0.0074153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>