218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2559 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  55.74 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  54.92 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  54.92 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  52.24 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  51.44 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  55.22 
 
 		 249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  51.19 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  51.39 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  52.02 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  52.44 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  52.03 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  55.36 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  53.63 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  51.63 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  48.7 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  55.56 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  50.45 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  50.45 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  46.35 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  42.24 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  44.17 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2607  flagellar basal body L-ring protein  49.34 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0744  flagellar basal body L-ring protein  44.77 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  41.08 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  43.9 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  42.19 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  43.15 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  44.4 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  44.4 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  46.03 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  42.08 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3680  flagellar L-ring protein  44.81 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0603  flagellar L-ring protein  45.25 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1685  flagellar L-ring protein  41.91 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  43.39 
 
 		 344 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  43.95 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0262  flagellar basal body L-ring protein  41.94 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0324  flagellar basal body L-ring protein  42.67 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0356  flagellar basal body L-ring protein  42.67 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  39.17 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3254  flagellar basal body L-ring protein  45.19 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  39.08 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  35.98 
 
 		 226 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  38.94 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  37.96 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  34.89 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  39.42 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  34.75 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  35.9 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  37.31 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  35.27 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  31.84 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.65 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.06 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.81 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  30.87 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  30.87 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  28.51 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  31.43 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  30.56 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  35.11 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  32.1 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  32.04 
 
 		 192 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1972  flagellar L-ring protein  29.18 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  34.05 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.18 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 220 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  28.49 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  29.32 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  30.51 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  33.02 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  33.49 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  28.4 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  30.17 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  34.09 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  34.09 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.57 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  30.16 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0627  flagellar L-ring protein  30.13 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.2 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  29.86 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  28.42 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>