219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1654 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  35.65 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  35 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  36.02 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  32.92 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  34.07 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  31.17 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  35.43 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  36.6 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  33.62 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  32.33 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  37.7 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.98 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  39.29 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  32.3 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  32.92 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  32.04 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  33.2 
 
 		 231 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  32.64 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  32.91 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  32.92 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  31.03 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  32.61 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.54 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  31.45 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  34.02 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  29.51 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  32.22 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  31.49 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  31.74 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  30.87 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  31.8 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  31.8 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  31.44 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  33.53 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  33.51 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  34.5 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  33.94 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  32 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  32 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  31.11 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  31.69 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  32 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  31.44 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  32.43 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  31.63 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  30.81 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  33.7 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  31.25 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  31.06 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  30.64 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2728  flagellar L-ring protein  29.96 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000599963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  31.5 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  33.03 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  29.24 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  31.5 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  30.61 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  29.74 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  33.47 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  31.4 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  30.6 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  31.87 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  26.89 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  32.17 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  26.89 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  32.87 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  31.89 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  31.5 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  32.24 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  32.16 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  31.63 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  27.92 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  30.63 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  30.63 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1108  flagellar L-ring protein  31.79 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  32.31 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  31.42 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  30.11 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  30.11 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1559  flagellar basal body L-ring protein  30.57 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.602881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  29.03 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  29.86 
 
 		 220 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  32.28 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  32.86 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  29.21 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>