218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3451 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  66.21 
 
 
224 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  67.32 
 
 
230 aa  290  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  67.32 
 
 
229 aa  289  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  60.96 
 
 
226 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  60.18 
 
 
229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  56.95 
 
 
221 aa  262  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  45.5 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  44.39 
 
 
229 aa  191  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  40.18 
 
 
232 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  35.96 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  40.74 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  39.78 
 
 
250 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  40.32 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  40.32 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  38.89 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  40.52 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  33.19 
 
 
229 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  36.22 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 
259 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  38.58 
 
 
249 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  40.32 
 
 
229 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  36.27 
 
 
252 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  34.65 
 
 
238 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  40.32 
 
 
229 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  42.25 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  35.2 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  34.44 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  36.6 
 
 
229 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  36.22 
 
 
252 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  35.23 
 
 
252 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  38.22 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  36 
 
 
235 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  38.22 
 
 
237 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 
252 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  37.56 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  32.89 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  37.5 
 
 
223 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  33.86 
 
 
239 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  34.72 
 
 
252 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  35.62 
 
 
231 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3649  flagellar L-ring protein  35.05 
 
 
344 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.284986  normal  0.903555 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  37.43 
 
 
232 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  36.07 
 
 
239 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  36.07 
 
 
239 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  34.95 
 
 
232 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  34.18 
 
 
225 aa  121  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  37.43 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  35.81 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  33.05 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  35.78 
 
 
232 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  34.65 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  32.48 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.45 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  38.66 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  34.82 
 
 
231 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  32.13 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  33.03 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  37.44 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  34.38 
 
 
231 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.53 
 
 
219 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  36.07 
 
 
244 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  32.46 
 
 
235 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  33.93 
 
 
231 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  32.11 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  37.31 
 
 
244 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  32.71 
 
 
230 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  35.23 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  33.98 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  34.19 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  35.53 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  30.36 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1042  flagellar L-ring protein  36.32 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0246  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  34.87 
 
 
229 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  34.36 
 
 
229 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  34.36 
 
 
229 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
240 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  34.36 
 
 
229 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  35.32 
 
 
220 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  34.52 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3000  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  35.35 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0284  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3348  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.876446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  35.35 
 
 
235 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  35.87 
 
 
222 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  35.38 
 
 
236 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  34.8 
 
 
224 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  33.04 
 
 
234 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  36.12 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  34.97 
 
 
240 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  34.65 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>